Yegor Voronin (shvarz) wrote,
Yegor Voronin
shvarz

Category:

Тест на устойчивость к ВИЧ

Вопрос к москвичам-биологам: Кто-нибудь может/хочет прогнать тест на мутацию в гене CCR5, дающую ее носителю устойчивость к ВИЧ? Вопрос не совсем праздный - ВИЧ-положительная мама хочет проверить своего новорожденного ребенка (ВИЧ-отрицательного). Она согласна заплатить за праймеры, полимеразу и т.п. Заодно можете проверить себя и своих знакомых :) В России около 15-20% являются носителями этого аллеля, то есть ВИЧ-устойчивых гомозигот должно быть примерно два-три на сотню.


Тест совсем простой, я им пользовался постоянно. Поскольку там делеция в 32 нуклеотида, то ПЦР+агарозный гель ее элементарно показывают.
Я пользовался следующими праймерами:
Прямой: gataggtacctggctgtggtccat
Обратный: accagccccaagatgactatct
Нормальный ген дает продукт в 238 нуклеотидов, с делецией - 206. Условий ПЦР не помню, но было что-то вполне стандартное, без выпендрежа.
Если нужна полная последовательность гена, то она вот: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NG_012637.1?&from=5000&to=11064&report=genbank Мои праймеры там начинаются, соответственно, с 3135 и 3373 позиций.
Tags: hiv, помощь зала
Subscribe

  • Возможное объяснение распространения дельты

    Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant Препринт, о котором я узнал из TWIV. Уже…

  • Про титры антител и защиту от болезни

    Неделю назад еще попросили объяснить разницу между этими двумя понятиями и почему они прямо не связаны, но руки дошли вот только сейчас, очень занят.…

  • Разбан

    По случаю дня американской независимости был произведен полный разбан всех забаненых, им всем выдан новый шанс проявить свой интеллект. Более того,…

  • Post a new comment

    Error

    Anonymous comments are disabled in this journal

    default userpic

    Your IP address will be recorded 

  • 30 comments

  • Возможное объяснение распространения дельты

    Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant Препринт, о котором я узнал из TWIV. Уже…

  • Про титры антител и защиту от болезни

    Неделю назад еще попросили объяснить разницу между этими двумя понятиями и почему они прямо не связаны, но руки дошли вот только сейчас, очень занят.…

  • Разбан

    По случаю дня американской независимости был произведен полный разбан всех забаненых, им всем выдан новый шанс проявить свой интеллект. Более того,…