Yegor Voronin (shvarz) wrote,
Yegor Voronin
shvarz

Categories:

Матрица приближается

В Nature статья (pdf) о том, что игроки в Foldit решили структуру белка протеазы вируса MPMV - задача, с которой давно уже не могли справиться ученые со всеми их компьютерами.
В игре Foldit обычные люди манипулируют районами белка и получают баллы за оптимизирование его сворачивания. Игра использует тот факт, что человеческий мозг очень хорошо приспособлен к манипуляциям со сложными трехмерными объектами - задача, с которой компьютеры до сих пор справляются с трудом.



На картинке показаны шаги, которые были проделаны тремя игроками в процессе решения этой задачи. Игрок spvincent проделал начальную оптимизацию исходной структуры, которая была получена с помощью NMR, правильно уложив бета-складки (B). Его структура была улучшена игроком grabhorn, который оптимизировал гидрофобный центр белка (C). Конечная оптимизация была сделана игроком mimi, которая догадалась загнуть торчавшую петлю в верхнем левом углу так, что она легла в нужное положение (D). Эту структуру уже доработали компьютеры, которые сравнивали ее с имеющейся кристаллографической информацией. Весь процесс занял три недели.

Создатели FoldIt постепенно добавляют арсенал инструментов, доступных игрокам. Например, если есть белок, для которого структура известна и он похож на тот, над которым работаете вы, то вполне возможно, что и сворачиваются они одинаково. Недавно в FoldIt был добавлен инструмент, позволяющий игрокам вручную выравнивать гомологичные последовательности белков для того, чтобы они могли использовать уже имеющуюся в базах данных информацию о структурах белков. Все это сделано так, что игрок не должен иметь никакого специального образования для того, чтобы помогать решать эти сложные задачи. Победитель этого соревнования, mimi, помогает делать научные эксперименты в школе.
(via The Scientist)
Tags: интересное, научпоп, новости науки
Subscribe

  • Мечтают ли роботы о свободе воли?

    Говорят, что теория о происхождении человека и обезьян от общего предка у очень многих людей вызвала экзистенциальный кризис. "Если человек произошел…

  • О человечестве

    Я уже как-то упоминал, что к нам в организацию приезжал антрополог, чтобы нас изучать. Он потом еще не раз возвращался. Бус так и не привез, но…

  • Homo sapiens

    В течение нескольких миллионов лет на Земле водилось множество видов "людей". Сто-двести тысяч лет назад появился Homo sapiens, а тридцать тысяч лет…

  • Post a new comment

    Error

    Anonymous comments are disabled in this journal

    default userpic

    Your IP address will be recorded 

  • 44 comments

  • Мечтают ли роботы о свободе воли?

    Говорят, что теория о происхождении человека и обезьян от общего предка у очень многих людей вызвала экзистенциальный кризис. "Если человек произошел…

  • О человечестве

    Я уже как-то упоминал, что к нам в организацию приезжал антрополог, чтобы нас изучать. Он потом еще не раз возвращался. Бус так и не привез, но…

  • Homo sapiens

    В течение нескольких миллионов лет на Земле водилось множество видов "людей". Сто-двести тысяч лет назад появился Homo sapiens, а тридцать тысяч лет…