Yegor Voronin (shvarz) wrote,
Yegor Voronin
shvarz

Category:

Биливердин и SARS-2

SARS-CoV-2 recruits a haem metabolite to evade antibody immunity

Попросили рассказать про эту статью, и хотя в итоге там оказалось совсем не то, про что спрашивали, статья однако все равно интересна, к тому же работали над ней люди, которых я неплохо знаю по их работам с ВИЧ.

Авторы являются структурными биологами, т.е. изучают как белки сворачиваются в определенные структуры и как потом форма этих структур определяет функцию белков. Для изучения структуры белка S коронавируса они наработали в клеточных культурах разные варианты этого белка. При этом они заметили, что если обычно растворы белков прозрачны, то эти белки имеют заметный зеленый оттенок, указывающий на присутствие какого-то пигмента. Поскольку они крутые биохимики, то им не составило большого труда выделить этот пигмент и определить что это биливердин.

Что такое биливердин? Наши эритроциты содержат белок гемоглобин, однако кислород связывается не с самим белком, а со специальным соединением - гемом, а белок лишь регулирует этот процесс, так что в легких кислород связывается с гемом очень хорошо, а в тканях - хуже, и таким образом высвобождается там где он нужен. Именно гем придает нашей крови красный цвет. Организм постоянно производит новые молекулы гема, потому что гем постепенно разрушается, сначала превращаясь в биливердин, а потом в билирубин, который и выводится по желчным каналам в кишечник и придает фекалиям характерный желто-коричневый цвет. Биливердин же зеленого цвета и именно благодаря ему наши синяки имеют сине-зеленый оттенок.

Самое загадочное в этой статье, и авторы это никак не объясняют, это откуда у них в клеточных культурах (в которых они производили белки) вдруг взялся биливердин? Я подозреваю, что они увидели этот зеленоватый цвет не просто в произведенных белках, а в белках которые в каких-то экспериментах для каких-то целей смешивались с кровью либо животных либо людей. Но это осталось за кадром.

Так или иначе, но авторы показывают, что белок S действительно очень хорошо связывается с биливердином, так что при нормальных концентрациях биливердина в крови (а его всегда там сколько-то есть), практически все копии белка несут на себе в совершенно определенном месте этот биливердин. Вот он зелененький на этой картинке:



Связывается биливердин в довольно интересном месте. На поверхности белка есть такая гибкая петля, которая постоянно болтается туда-сюда, подобно незапертой калитке. И в положении "туда" она открывает нейтрализующим антителам доступ к довольно уязвимой части белка. Биливердин вклинивается недалеко от калитки и запирает ее в положении "сюда" не давая ей полностью открыться. Таким образом нейтрализующие антитела, которые атакуют вирус в этом месте (и их похоже довольно много) оказываются неэффективными.

Авторы считают что это такой механизм избегания иммунного ответа. Я не совсем согласен, мне кажется что это никакой не механизм, а просто белок такой вот и есть в норме, с биливердином в этом месте, и "калитка" эта в норме и не должна открываться потому что там всегда ее придерживает биливердин. А если бы его не было, то вирус бы нашел другой способ держать калитку на запоре. Что собственно они сами и показывают - белки S из обычных сезонных коронавирусов биливердин не связывают (а вот SARS-1 - да).

Но вот на что эта работа действительно указывает, так это на то, что если измерять нейтрализацию вируса плазмой (и многими моноклональными антителами) в культуре клеток, то можно получить результаты, которые не соответствуют тому, что реально происходит в организме. Антитело может нейтрализовать вирус в культуре, но не нейтрализовать в организме. Или же надо всегда добавлять биливердин к вирусу в тестах проводимых на культурах клеток.
Subscribe

  • Возможное объяснение распространения дельты

    Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant Препринт, о котором я узнал из TWIV. Уже…

  • Про титры антител и защиту от болезни

    Неделю назад еще попросили объяснить разницу между этими двумя понятиями и почему они прямо не связаны, но руки дошли вот только сейчас, очень занят.…

  • Разбан

    По случаю дня американской независимости был произведен полный разбан всех забаненых, им всем выдан новый шанс проявить свой интеллект. Более того,…

  • Post a new comment

    Error

    Anonymous comments are disabled in this journal

    default userpic

    Your IP address will be recorded 

  • 37 comments

  • Возможное объяснение распространения дельты

    Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant Препринт, о котором я узнал из TWIV. Уже…

  • Про титры антител и защиту от болезни

    Неделю назад еще попросили объяснить разницу между этими двумя понятиями и почему они прямо не связаны, но руки дошли вот только сейчас, очень занят.…

  • Разбан

    По случаю дня американской независимости был произведен полный разбан всех забаненых, им всем выдан новый шанс проявить свой интеллект. Более того,…